清洗水箱包含外部与内部，假如在正常更换冷却液的状况下，内部大多数不会有问題。假如很长时间不更换冷却液，而且液体已经显著浑浊，里外基本都需要清洗，不然基本都会影响散热效果。
内部清洗水箱内部清洗比较简单，由于不会有尘土进到，只要购买专用的清洗剂加入到水箱中，发动机点火循环几分钟后，浸泡数小时循环排放就可以了。这样的方法有的发动机装有排泄阀门，而有的需要拆卸发动机下水管，使内部的杂质完全排出，排完之后紧固下水管就可以了。下水管在水箱的下部的位置。
要注意：使用自来水洗干净之后，在加入新的防冻液，而且在发动机冷却时实行排放！！！
外部清洗水箱外部比较难以清洗，由于前部被保险杆遮挡，后部还装有冷却风扇装置，假如不实行拆卸非常难全方位清洗。假如在修理厂实行修理可能同样是一笔不小的花费，毕竟需要拆卸保险杆以及中网，还关系到到冷却风扇，修理流程还是比较麻烦的。
对想省钱的车友们，也可以自己动手。首要任务是需要加热防冻液，溫度升高之后有利于软化散热器表层的污渍，然后才使用专业的清洗剂向散热器喷射，浸泡几分钟后实行清水冲洗。对有些无法接触的地方，可以用外接软管，然后才绑定在软铁丝上，改变铁丝的角度就可以了解决无法接触到的难題。
要注意：使用清水冲洗时要注意压力，以防散热片切斜
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